多收员工社保费应计入其他应付款科目中。

会计分录为：

借：应付职工薪酬

贷：其他应付款

其他应付款的账务处理：

企业应付、暂收其他单位或个人的款项，如应付租入固定资产和包装物的租金，存入保证金、应付、暂收所属单位、个人的款项、管辖区内业主和物业管户装修存入保证金;应付职工统筹退休金，以及应收暂付上级单位、所属单位的款项。

(1)计提员工工资1000元时：

借：管理费用/销售费用/制造费用/在建工程

贷：应付职工薪酬

(2)实际发放职工工资时：

借：应付职工薪酬

贷：银行存款

其他应收款-个人社保

(3)缴纳职工社保时：

借：管理费用/销售费用/制造费用/在建工程

其他应收款-社保(个人)

贷：银行存款

(4)发放多扣员工社保费

借：其他应收款-社保(个人)

贷：银行存款