在月底申报个人所得税的时候，就不申报劳务公司的那部分工资，只申报余下的部分职工工资。这样的处理没有问题。可以不从应付职工薪酬走。因为你是支付的劳务外包费用，不是直接支付的工资，可以直接省略那一部分，从其他应付款走。

公司内部人员的劳务费，不是通过劳务公司，做账的时候要不要通过应付职工薪酬走，会计分录如何做?

一样需要通过应付职工薪酬，但是二级科目可以和应付工资分开，账务系统中应付职工薪酬二级科目有很多，可以发放在劳务费科目上。

提取的时候

借：管理费用-工资 贷：应付职工薪酬-工资 (或 劳务费)

发放的时候

借：应付职工薪酬-工资 (或 劳务费) 贷：现金